| 北海道コンサドーレ札幌 | 3 - 0 | 筑波大学 |
| FC岐阜 | 1 - 2 | Honda FC |
| ブラウブリッツ秋田 | 2 - 0 | ヴァンラーレ八戸 |
| 松江シティFC | 1 - 4 | ファジアーノ岡山 |
| ザスパクサツ群馬 | 1 - 0 | ソニー仙台FC |
| 福島ユナイテッドFC | 4 - 0 | ザスパ草津チャレンジャーズ |
| SRC広島 | 0 - 4 | 愛媛FC |
| ギラヴァンツ北九州 | 1 - 0 | 福岡大学 |
| AC長野パルセイロ | 5 - 0 | 北陸大学 |
| カターレ富山 | 1 - 0 | 新潟医療短期大学 |
| ガイナーレ鳥取 | 5 - 0 | ファジアーノ岡山ネクスト |
| FC町田ゼルビア | 0 - 1 | 神奈川大学 |
| 徳島ヴォルティス | 6 - 0 | FC徳島セレステ |
| 大分トリニータ | 3 - 0 | MD長崎 |
| 水戸ホーリーホック | 1 - 0 | 東京国際大学 |
| モンテディオ山形 | 2 - 1 | アルテリーヴォ和歌山 |
| レノファ山口FC | 4 - 0 | 東海大熊本 |
| 東京ヴェルディ | 2 - 1 | VONDS市原 |
| ジェフユナイテッド市原・千葉 | 5 - 0 | 北海道教育大学岩見沢校 |
| V・ファーレン長崎 | 2 - 1 | 高知ユナイテッドSC |
| 清水エスパルス | 2 - 1 | 関西大学 |
| FC琉球 | 1 - 0 | ホンダロックSC |
| 栃木ウーヴァFC | 1 - 1
(PK3-4) | 山梨学院大学オリオンズ |
| 東海学園大学 | 1 - 2 | 鈴鹿アンリミテッドFC |
| 奈良クラブ | 2 - 0 | 京都産業大学 |
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