| コンサドーレ札幌 | 5 - 1 | 札幌大学 |
| 奈良クラブ | 0 - 0
(5PK6 | 藤枝MYFC |
| 徳島ヴォルティス | 7 - 0 | ファジアーノ岡山ネクスト |
| ザスパクサツ群馬 | 1 - 2 | FC岐阜セカンド |
| 松本山雅FC | 3 - 0 | サウルコス福井 |
| ギラヴァンツ北九州 | 2 - 1 | FC MIYAZAKI |
| ロアッソ熊本 | 1 - 0 | 福岡大学 |
| 栃木SC | 0 - 0
(3PK4) | 流通経済大学 |
| V・ファーレン長崎 | 7 - 0 | 三菱重工長崎 |
| 水戸ホーリーホック | 4 - 2 | ラインメール青森 |
| セレッソ大阪 | 1 - 2 | FC大阪 |
| ガイナーレ鳥取 | 2 - 1 | ファジアーノ岡山 |
| ジュビロ磐田 | 1 - 0 | 北陸大学 |
| 大宮アルディージャ | 4 - 0 | 栃木ウーヴァ |
| 東京ヴェルディ | 5 - 1 | JAPANサッカーカレッジ |
| ジェフユナイテッド市原・千葉 | 3 - 0 | 東京国際大学 |
| 大分トリニータ | 2 - 0 | 佐賀LIXIL |
| モンテディオ山形 | 7 - 1 | 山形大学医学部 |
| 松江シティ | 1 - 0 | 鹿児島ユナイテッドFC |
| FCマルヤス岡崎 | 1 - 4 | 桐蔭横浜大学 |
| MIOびわこ滋賀 | 3 - 2 | アルテリーヴォ和歌山 |
| 韮崎アストロス | 0 - 3 | 順天堂大学 |
| 四日市大学 | 1 - 6 | ヴェルスパ大分 |
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