| 順位 | チーム | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失 点差 | 総勝ち点 |
| 1 | ★横浜FC |
48 |
26 | 15 | 7 |
61 | 32 | +28 |
93 |
| 2 | ★柏レイソル |
48 |
27 | 7 | 14 |
84 | 60 | +24 |
88 |
| 3 | ★ヴィッセル神戸 |
48 |
25 | 11 | 12 |
78 | 53 | +25 |
86 |
| 4 | サガン鳥栖 |
48 |
22 | 13 | 13 |
64 | 49 | +15 |
79 |
| 5 | ベガルタ仙台 |
48 |
21 | 14 | 13 |
75 | 43 | +32 |
77 |
| 6 | コンサドーレ札幌 |
48 |
20 | 12 | 16 |
77 | 67 | +10 |
72 |
| 7 | 東京ヴェルディ1969 |
48 |
21 | 8 | 19 |
69 | 75 | -6 |
71 |
| 8 | モンテディオ山形 |
48 |
20 | 14 | 17 |
68 | 57 | +11 |
65 |
| 9 | 愛媛FC |
48 |
14 | 11 | 23 |
51 | 63 | -12 |
53 |
| 10 | 水戸ホーリーホック |
48 |
14 | 9 | 25 |
48 | 69 | -21 |
51 |
| 11 | 湘南ベルマーレ |
48 |
13 | 10 | 25 |
61 | 87 | -26 |
49 |
| 12 | ザスパ草津 |
48 |
9 | 14 | 24 |
54 | 86 | -32 |
42 |
| 13 | 徳島ヴォルティス |
48 |
8 | 11 | 29 |
43 | 92 | -49 |
35 |
|