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| 順位 | チーム | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失 点差
 | 勝ち点 | 
|---|
 
| 1 | ★レノファ山口FC | 36 | 25 | 3 | 8 | 96 | 36 | +60 | 78 |  
| 2 | ★FC町田ゼルビア | 36 | 23 | 9 | 4 | 52 | 18 | +34 | 78 |  
| 3 | AC長野パルセイロ | 36 | 21 | 7 | 8 | 46 | 28 | +18 | 70 |  
| 4 | SC相模原 | 36 | 17 | 7 | 12 | 59 | 51 | +8 | 58 |  
| 5 | カターレ富山 | 36 | 14 | 10 | 12 | 37 | 36 | +1 | 52 |  
| 6 | ガイナーレ鳥取 | 35 | 14 | 8 | 14 | 47 | 41 | +6 | 50 |  
| 7 | 福島ユナイテッドFC | 36 | 13 | 10 | 13 | 42 | 48 | -6 | 49 |  
| 8 | ブラウブリッツ秋田 | 36 | 12 | 9 | 15 | 37 | 40 | -3 | 45 |  
| 9 | FC琉球 | 36 | 12 | 9 | 15 | 45 | 51 | -6 | 45 |  
| 10 | 藤枝MYFC | 36 | 11 | 4 | 21 | 37 | 61 | -24 | 37 |  
| 11 | グルージャ盛岡 | 36 | 8 | 11 | 17 | 36 | 47 | -11 | 35 |  
| 12 | Jリーグ U-22選抜 | 36 | 7 | 7 | 22 | 28 | 71 | -43 | 28 |  
| 13 | Y.S.C.C横浜 | 36 | 7 | 6 | 23 | 24 | 58 | -34 | 27 |  |