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| 順位 | チーム | 試合数 | 勝 | 分 | 負 | 得点 | 失点 | 得失 点差
 | 勝ち点 | 
|---|
 
| 1 | ★FC琉球 | 32 | 20 | 6 | 6 | 70 | 40 | +30 | 66 |  
| 2 | ★鹿児島ユナイテッドFC | 32 | 16 | 9 | 7 | 46 | 35 | +11 | 57 |  
| 3 | ガイナーレ鳥取 | 32 | 15 | 8 | 9 | 61 | 47 | +14 | 53 |  
| 4 | アスルクラロ沼津 | 32 | 14 | 10 | 8 | 40 | 29 | +11 | 52 |  
| 5 | ザスパクサツ群馬 | 32 | 15 | 7 | 10 | 37 | 35 | +2 | 52 |  
| 6 | ガンバ大阪U-23 | 32 | 13 | 8 | 11 | 53 | 43 | +10 | 47 |  
| 7 | セレッソ大阪U-23 | 32 | 13 | 7 | 12 | 47 | 36 | +11 | 46 |  
| 8 | ブラウブリッツ秋田 | 32 | 12 | 7 | 13 | 37 | 35 | +2 | 43 |  
| 9 | SC相模原 | 32 | 12 | 6 | 14 | 42 | 53 | -11 | 42 |  
| 10 | AC長野パルセイロ | 32 | 10 | 11 | 11 | 39 | 37 | +2 | 41 |  
| 11 | カターレ富山 | 32 | 12 | 5 | 15 | 41 | 50 | -9 | 41 |  
| 12 | 福島ユナイテッドFC | 31 | 9 | 13 | 10 | 36 | 43 | -7 | 40 |  
| 13 | グルージャ盛岡 | 32 | 12 | 4 | 16 | 41 | 56 | -15 | 40 |  
| 14 | FC東京U-23 | 32 | 10 | 6 | 16 | 38 | 45 | -7 | 36 |  
| 15 | Y.S.C.C横浜 | 32 | 8 | 10 | 14 | 40 | 48 | -8 | 34 |  
| 16 | 藤枝MYFC | 32 | 10 | 4 | 18 | 32 | 48 | -16 | 34 |  
| 17 | ギラヴァンツ北九州 | 32 | 6 | 9 | 17 | 22 | 42 | -20 | 27 |  |